Yeast6kArray.py -- Information about the 6,000-probe intergenic array used in papers from the
                   laboratory of Richard Young.  Array uses PCR products, and much of the data
                   accessed by the routines herein are based on in silico PCR predictions by the
                   Fraenkel lab.
 
Copyright (2005) Whitehead Institute for Biomedical Research (except as noted below)
All Rights Reserved
 
Author: David Benjamin Gordon

Modules
		TAMO.Datasources.SGD TAMO math re

Classes
		Spot chr_pos   class Spot     A spot on the microarrray (name, position(s))     Methods defined here: __init__(self, csvline='')   class chr_pos     A chromosomal position     Methods defined here: __init__(self, start=None, stop=None, chr=None) __repr__(self)

Functions
		cendist(spotname) Distance from feature (spot) to nearest centromeme gene2func(gene) gene2orf(gene) gene2probe(gene) gene2probes(gene) maptype(orf, probe) orf2func(orf) orf2gene(orf) orf2probe(orf) orf2probes(orf) pcr_bad(probe_id) probe2func(probe) probe2funcs(probe) probe2gene(probe) probe2genes(probe) probe2orf(probe) probe2orfs(probe) spot_bias(probe_id) spot_pos(probe_id) What are the chromosomal coordinates associated with the ePCR prediction of this spot? stringent_filter(ids, bias_cutoff=10) telomeredist(spotname) Distance from feature (spot) to nearest telomere